Котлы подобного типа очень требовательны к теплоносителю, ведь он одновременно является и элементом электрической цепи, а, следовательно, должен обладать необходимым сопротивлением для эффективной работы котла. Например, нагрев дистиллированной воды в системах отопления не будет иметь успеха. Поэтому необходимо либо использовать специальный теплоноситель, который часто предлагает фирма разработчик котла, либо самому подсаливать воду и методом проб определить оптимальную ее концентрацию. Все эти манипуляции с теплоносителем существенно ограничивают использование электролизных котлов.
недостаткам электрических котлов относят существенные ограничения по мощности: даже мощный трехфазный котел не в силах обогреть средний по размеру коттедж. Поэтому электрокотлы часто применяют для отопления небольших помещений (квартир, котельных, подсобок и т. д.) или в качестве "резервных".